Для тестов использовал pdf-ку размером в 12мб.
Из коммандлайновых утилит нашел такую: https://github.com/coolwanglu/pdf2htmlEX/wiki/Building. Дала единую html-ку размером 30мб.
Есть еще сайт https://pdf.io/pdf2html/, тоже работает. HTML-ка получилась тоже одна но в 2 раза больше чем от коммандлайновой утилиты: 75мб.
UPD ссылка на скачивание утилиты https://github.com/coolwanglu/pdf2htmlEX/wiki/Download